Βαθιά ευγνωμοσύνη για τη θετική συμβολή του Αρχιεπισκόπου Χρυσόστομου ΙΙ στο ζωτικό ταξίδι προς την πλήρη Κοινωνία Ορθοδόξων και Καθολικών εξέφρασε ο Πάπας Φραγκίσκος σε μήνυμά του, το οποίο διάβασε κατά την κηδεία του Αρχιεπισκόπου ο Καρδινάλιος Κουρτ Κοχ.
Ο Πάπας εξέφρασε λύπη για τον θάνατο του Αρχιεπισκόπου, εκφράζοντας από καρδιάς συλλυπητήρια προς την Ιερά Σύνοδο και τους πιστούς της Κύπρου.
Σημείωσε πως ο Αρχιεπίσκοπος αφιέρωσε τη ζωή του στην υπηρεσία του Ευαγγελίου και με το έργο του συνέβαλε στην πνευματική ανάπτυξη του ποιμνίου του.
Επίσης ο Πάπας υπενθύμισε τη συνάντηση που είχε με τον Αρχιεπίσκοπο πέρσι στην Κύπρο, εκφράζοντας την πεποίθηση πως η μνήμη του θα συνεχίσει να εμπνέει τους απανταχού Χριστιανούς.
Είπε ακόμη πως θα συνεχίσει να προσεύχεται, ζητώντας από τον Θεό να δώσει παρηγοριά, γαλήνη και ειρήνη στον λαό της Κύπρου.